HONLAP | TÖRTÉNELEM | KOLLÉGÁK | FUNKCIÓS CSOPORTOK | KÖZLEMÉNYEK | HALLGATÓKNAK | DOKTORANDUSZOKNAK
SEMMELWEIS EGYETEM
Orvosi Vegytani, Molekuláris Biológiai és Patobiokémiai Intézet
Doktoranduszképzéssel kapcsolatos információk

Posztgraduális képzés

SEMMELWEIS EGYETEM
Molekuláris Orvostudományok Tudományági Doktori Iskola
(Iskolavezető: Dr. Mandl József egyetemi tanár)

Patobiokémia program
(Programvezető: Dr. Mandl József)
Tanulmányi felelős: Dr. Vér Ágota
(e-mail: molorv@eok.sote.hu)



lap teteje, TÉMÁK, KURZUSOK, HALLGATÓK, TÉTELEK

A Patobiokémia programban az Intézet munkatársai által vezetett kutatási témák

Kutatási téma Témavezető
Az endoplazmás retikulum transzportrendszerei Dr. Bánhegyi Gábor
A drogfüggés és egyéb pszichiátriai zavarok kialakulásában szerepet játszó genetikai variánsok kutatása Dr. Barta Csaba
Idegrendszeri állvány fehérjék vizsgálata Dr. Buday László
Kis G-fehérjék a sejtműködésben Dr. Buday László
Tirozin kináz receptorok jelpályáinak vizsgálata Dr. Buday László
Glukuronidok sorsa a máj endoplazmatikus retikulumában Dr. Csala Miklós
Fehérjeérés és -minőségellenőrzés az endoplazmás retikulumban Dr. Csala Miklós
Redox metabolizmus az endoplazmás retikulumban Dr. Csala Miklós
Tanulás és memória mechanizmusainak kísérletes és hálózatos vizsgálata Dr. Csermely Péter
Dr. Sőti Csaba
Jeltovábbítási terápia kináz inhibitorokkal Dr. Kéri György
Kináz gátló molekulák előállítása racionális hatóanyagtervezéssel Dr. Kéri György
Antitumor és gyulladásgátló peptidek és hatásmechanizmusaik – szignáltranszdukciós terápia Dr. Kéri György
Az endoplazmás retikulum stressz molekuláris mechanizmusai Dr. Mandl József
Új szelektív antitumor hatású tirozin kináz inhibítor molekulák vizsgálata, a szerkezet és a biológiai hatás közti összefüggések modellezése Dr. Mészáros György
Fehérje specifikus aptamerek szelekciója és alkalmazása Dr. Mészáros Tamás
Monoamin neurotranszmitter rendszerek genetikai polimorfizmusainak funkcionális vizsgálata és asszociáció-elemzése Dr. Nemoda Zsófia
A sejthalál szabályozására ható jelátviteli terápiák molekuláris farmakológiája és kísérő farmakodiagnosztikája Dr. Peták István
A genom kis és nagy kiterjedésű ismétlődési polimorfizmusainak vizsgálata Dr. Rónai Zsolt
Komplex öröklődésű betegségek genetikai rizikófaktorainak kutatása Dr. Sasvári Mária
Stresszválaszok az öregedésben Dr. Sőti Csaba
A fehérje denaturáció és a stresszválasz szerepe az öregedésben Dr. Sőti Csaba
A Na/K-ATPáz szerepe diabetes pathomechanizmusában Dr. Vér Ágota


lap teteje, TÉMÁK, KURZUSOK, HALLGATÓK, TÉTELEK

Patobiokémia program keretében az Intézet oktatói által meghirdetett kurzusok
2011/2012 I. félév
(lásd még: phd.sote.hu honlapon "kurzusok")

Kurzusvezető Kurzus címe
Dr. Mandl József Patobiokémia alapjai
Dr. Buday László Fehérje foszforiláció szerepe a sejtműködés szabályozásában
Dr. Peták István, Dr. Rónai Zsolt Molekuláris alkattan (molekuláris személyiségjegyek)



Semmelweis Egyetem Doktori Iskolája által meghirdetett kötelezően választható az Intézet oktatói által tartott kurzus
2011/2012 I. félév
(lásd még: phd.sote.hu honlapon "kurzusok")

Kurzusvezető Kurzus címe
Dr. Sasvári Mária, Dr. Sipeki Szabolcs, Dr. Váradi András Molekuláris biológiai alapismeretek



Molekuláris Orvostudományok Tudományági Doktori Iskola patobiokémia programjának kurzusterve 2014-ig

Kurzusvezető Kurzus címe   2010/11 2011/12 2012/13 2013/14
2 1 2 1 2 1 2
Minden MOLORV hallgatónak kötelező
Dr. Sasvári Mária, Dr. Sipeki Szabolcs, Dr. Váradi András Molekuláris biológiai alapismeretek KV x            
Minden MOLORV hallgatónak az alábbi háromból minimum egy kötelező
Dr. Vasas Lívia Irodalomkutatási módszerek KV              
Dr. Dinya Elek Bevezetés a biometriába KV              
Dr. Anderlik Piroska Kísérleti állatok - állatkísérletek KV              
A Patobiokémia program hallgatóinak kötelező kurzusok
Dr. Mandl József Patobiokémia alapjai 7/2   x         x
Dr. Csala Miklós, Dr. Mészáros Tamás, Dr. Rónai Zsolt Fehérjék és nukleinsavak in silico, in vitro, elmélet és gyakorlat 7/2 x       x    
Patobiokémia program nem kötelező kurzusai
Dr. Bánhegyi Gábor Metabolikus szindroma molekuláris pathológiája 7/2           x  
Dr. Kéri György Jeltovábbítási terápia és racionális hatóanyagtervezés 7/2 x     x     x
Dr. Buday László Fehérje foszforiláció szerepe a sejtműködés szabályozásában 7/2   x          
Dr. Sarkadi Balázs A biológiai membránok felépítése és működése 7/2     x   x   x
Dr. Csala Miklós Biotranszformáció 7/2     x     x  
Dr. Csermely Péter A hálózatok és a stabilitás 7/2 x   x   x    
Dr. Machovich Raymund Hemosztázis 7/2       x      
Dr. Peták István, Dr. Rónai Zsolt Molekuláris alkattan (betegségek genetikai háttere) 7/2   x       x  


lap teteje, TÉMÁK, KURZUSOK, HALLGATÓK, TÉTELEK

Az Intézetben dolgozó PhD hallgatók

Molekuláris Orvostudományok Patobiokémia program
  Hallgató Témavezető Előmenetel
ö Elek Zsuzsanna Dr. Rónai Zsolt 1. félév
ö Gyurkó Márton Dávid Dr. Sőti Csaba 3. félév
ö Nagy Szilvia Krisztina Dr. Mészáros Tamás 5. félév
ö Nánási Tibor Dr. Sasvári Mária 1. félév
ö Németh Nóra Dr. Rónai Zsolt 3. félév
ö Pesti Szabolcs József Dr. Buday László 5. félév
ö Somogyvári Milán Dr. Sőti Csaba 1. félév
ö Szalay Kristóf Zsolt Dr. Csermely Péter 3. félév
ö Szeitner Zsuzsanna Dr. Mészáros Tamás 1. félév

ö =     ösztöndíjas
k =     költségtérítéses
kkk = Kooperációs Kutatóközpont
küf. = küföldi hallgató

Gyógyszertudományok Doktori Iskola
Hallgató Témavezető
Kurkó Ibolya Dr. Vántus Tibor
Varga Attila Dr. Vántus Tibor
Gyulavári Pál Dr. Vántus Tibor
Szabó Laura Dr. Kéri György



Az Intézetben dolgozó, fokozatszerzésre jelentkezett hallgatók

Hallgató Témavezető
Dr. Kovács-Nagy Réka Dr. Rónai Zsolt
Literáti-Nagy Zsuzsa Dr. Mandl József
Palotai Robin Dezső Dr. Csermely Péter
Szelényi Péter Dr. Csala Miklós



Az Intézetben végzett kutató munka alapján PhD fokozatot szerzett hallgatók (1997-)

Fokozatot szerzett Év Témavezető
Dr. Braun László 1997 Dr. Mandl József
Dr. Csala Miklós 1999 Dr. Mandl József
Dr. Puskás Ferenc 1999 Dr. Mandl József
Dr. Wunderlich Lívius 2000 Dr. Faragó Anna
Dr. Schnaider Tamás 2000 Dr. Csermely Péter
Dr. Szőke Melinda 2000 Dr. Staub Mária és Dr. Sasvári Mária
Dr. Sipeki Szabolcs 2001 Dr. Faragó Anna
Dr. Csapó Zsolt 2001 Dr. Staub Mária és Dr. Sasvári Mária
Dr. Rónai Zsolt 2002 Dr. Staub Mária és Dr. Sasvári Mária
Dr. Barta Csaba 2002 Dr. Sasvári Mária
Dr. Steták Attila  2002 Dr. Kéri György
Dr. Sőti Csaba 2002 Dr. Csermely Péter
Dr. Kardon Tamás 2002 Dr. Mandl József
Dr. Győrffy Erika 2002 Dr. Kéri György
Dr. Nemoda Zsófia  2002 Dr. Sasvári Mária
Dr. Szarka András 2003 Dr. Bánhegyi Gábor
Dr. Tamás Péter 2003 Dr. Buday László
Dr. Nardai Gábor 2003 Dr. Csermely Péter
Dr. Arnere Subbarao Sreedhar 2004 Dr. Csermely Péter
Dr. Valent Sándor 2004 Dr. Tóth Miklós
Dr. Gujdár Annamária 2005 Dr. Faragó Anna
Dr. Keszler Gergely 2005 Dr. Staub Mária
Dr. Papp Eszter 2006 Dr. Csermely Péter
Dr. Kukor Zoltán 2006 Dr. Tóth Miklós
Lótosné Dr. Varsányi Marianne 2006 Dr. Bánhegyi Gábor
Dr. Illés András 2006 Dr. Buday László
Dr. Erős Dániel 2006 Dr. Kéri György
Dr. Margittai Éva 2007 Dr. Csala Miklós
Dr. Czegle Ibolya 2007 Dr. Bánhegyi Gábor
Dr. Kereszturi Éva 2007 Dr. Sasvári Mária
Dr. Lizák Beáta 2008 Dr. Bánhegyi Gábor
Dr. Nagy Gábor 2008 Dr. Mandl József
Dr. Rosta Klára 2009 Dr. Vér Ágota
Dr. Balázs Annamária 2009 Dr. Buday László
Dr. Magyar Éva Judit 2011 Dr. Csala Miklós
Dr. Balogh Zsófia 2011 Dr. Mészáros Tamás



Az intézetben dolgozó témavezetők más doktori iskolákban fokozatot szerzett hallgatói

Fokozatot szerzett Év Témavezető Doktori Iskola
Hargitai Judit 2005 Dr. Csermely Péter ELTE Biológiai Doktori Iskola (biológiai tudományok)
Szántai Eszter 2005 Dr. Sasvári Mária ELTE Biológiai Doktori Iskola (biológiai tudományok)
Székelyhidi Zsolt 2006 Dr. Kéri György Semmelweis Egyetem, Gyógyszertudományok Doktori Iskola
Héjjas Krisztina 2009 Dr. Rónai Zsolt ELTE Biológiai Doktori Iskola (biológiai tudományok)
Huszár Mónika 2011 Dr. Idei Miklós Semmelweis Egyetem, Gyógyszertudományok Doktori Iskola


lap teteje, TÉMÁK, KURZUSOK, HALLGATÓK, TÉTELEK

Patobiokémia program doktori szigorlat főtárgy témakörei


Patobiokémia alapjai (anyagcsere folyamatok és zavarok)
  1. Intracelluláris fehérjeegyensúly zavarai - kóros fehérjék
  2. Öregedés patobiokémiája
  3. Pszichiátriai betegségek patobiokémiája
  4. Oxigénhomeosztázis zavarai. Hipoxia jelpálya és patobiokémiai vonatkozásai
  5. Immunpatobiokémia - allergia
  6. A szekréciós pálya patobiokémiája
  7. Mitokondriális betegségek
  8. Peroxiszómák patobiokémiája
  9. Citoszkeleton patobiokémiája
  10. Extracelluláris mátrix patobiokémiája
  11. Apoptózis - autofágia
  12. Az inzulin jelpálya – rendszere, a diabetes mellitus patobiokémiája
  13. A koleszterin-anyagcsere áttekintése, a szabályozásában résztvevő transzkripciós faktorok működése, a koleszterin-anyagcsere zavarai
  14. A szteroid-anyagcsere, annak kóros vonatkozásai és korrekciós lehetőségei
  15. A máj szerepe az anyagcsere-folyamatok integrációjában
  16. A biotranszformáció sémája, legfontosabb reakciói és enzimei
  17. Az alkohol metabolizmusa és az alkoholos májkárosodás patobiokémiája
  18. A hemosztázis szabályozásában résztvevő mediátorok és jelpályák Az endotélium és funkciózavarai. A véralvadás és zavarai
Felkészülésre ajánlott tankönyvek:
Mandl József, Machovich Raymund: Orvosi patobiokémia
Lehninger-Nelson-Cox: Principles in Biochemistry
Devlin: Biochemistry


Molekuláris biológia
  1. A humán genom megfejtése, egyedi genom programok, DNS szekvenálási módszerek
  2. A DNS szekvencia variációi: polimorfizmusok és mutációk
  3. Replikáció prokariótákban és eukariótákban. A DNS polimerázok tulajdonságai és alkalmazásuk a polimeráz lánc reakció (PCR) során
  4. A PCR alkalmazása a klinikumban. Genetikai tanácsadás
  5. A transzkripció mechanizmusa prokariótákban és eukariótákban
  6. Géncsendesítés (metiláció, hiszton acetiláció)
  7. A transzkripció aktiválása (enhancerek, transzkripciós faktorok)
  8. A DNS-fehérje interakció tanulmányozása (elektroforetikus mobilitás változás, EMSA), kromatin immunprecipitáció (ChIP), ChIP-on chip és ChIP-Seq)
  9. Az RNS érési folyamatai, a kis RNS-ek fajtái és szerepe
  10. Fehérjeszintézis prokariótákban és eukariótákban, transzlációs szintű szabályozás
  11. Posztranszlációs folyamatok és szabályozási mechanizmusok
  12. Rekombináns DNS technológiák: klónozás, riporter gének, expressziós vektorok
  13. Vizsgálandó fehérjék in vitro transzlációja és overexpressziója eukarióta sejtekben
  14. Génexpresszió analízise kvantitatív RT-PCR, valamint Western-blot felhasználásával
  15. Ismeretlen fehérje azonosítása fehérjeszekvenálás alkalmazásával
  16. Aptamerek előállítása és alkalmazási lehetőségei
  17. Irányított mutagenezis vektorokban, génkiütött és géncsendesített állatmodellek
  18. Rekombináns gyógyszerek előállításainak elve
  19. A génterápia lehetőségei
Felkészülésre ajánlott tankönyvek:
Lehninger-Nelson-Cox: Principles in Biochemistry
Devlin: Biochemistry


A sejtműködés szabályozásának molekuláris alapjai
  1. Az extracelluláris jeleket felfogó receptorok típusai az egyes jelpálya rendszerek áttekintése (főbb vonalakban)
  2. Ioncsatornák
  3. Heterotrimer GTP-kötő fehérjékkel működő receptorok szerkezete, a heterotrimer GTP-kötő fehérjék működése
  4. Protein-kinázok és foszfoprotein-foszfatázok (csoportosítása, szerkezete, működése, szerepe). A legjobban ismert protein-kinázok jellegzetességei
  5. cAMP-mediátorral működő jelpálya részletes jellemzése
  6. A cGMP-vel működő jelpályák. A NO mint kémiai jel
  7. A Ca2+ mint intracelluláris mediátor
  8. Tirozinkináz aktivitással rendelkező receptorok által indított jelpályák főbb komponensei
  9. A kismolekulasúlyú GTP-kötő fehérjék működése, a p21ras aktiválódásának mechanizmusa, szerepe
  10. A sejtorganellumokból kiinduló jelpályák, az endoplazmás retikulum stresszválasza
  11. "Cross-talk" a különböző jelpályák között
  12. Citokinek receptorai és jelpályái
  13. T limfociták aktiválódásának mechanizmusa
  14. Foszforiláció – defoszforiláció segítségével szabályozott transzkripciós faktorok működése
  15. Intracelluláris receptorokkal rendelkező jelpályák, hormonokat és anyagcsere-intermediereket kötő "magi receptorok"
  16. Protoonkogén – onkogén produktumok kapcsolata a jelpályákkal
  17. A sejtciklus szabályozásában résztvevő protein-kinázok működése, a G2/M határán működő regulációs mechanizmus
  18. Tumor szupresszor gének produktumainak szerepe a sejtciklus szabályozásában
Felkészülésre ajánlott tankönyvek:
Lehninger-Nelson-Cox: Principles in Biochemistry
Devlin: Biochemistry


Szakma specifikus szigorlati kérdések egyéni fokozatszerzők számára
  1. A fehérjék szerkezeti szintjei és vizsgálatuk (X-ray, NMR,…)
  2. Fehérje-fehérje kölcsönhatások vizsgálata (in vivio technikák: FRET, két-hibrid teszt; in vitro technikák: immunprecipitáció)
  3. Enzimek izolálása és tisztítása, enzimaktivitás-mérés az orvosi gyakorlatban
  4. A sejtek szeparációja és tenyésztése
  5. Elválasztástechnikai eljárások (hagyományos gélelektroforézis, kapilláris elektroforetikus technikák, mikrofluidikai módszerek) alkalmazása a molekuláris biológiában
  6. A sejten belüli elem- és ionkoncentrációk mérése, áramlási citometria
  7. Mikroszkópiai módszerek, konfokális, elektron és atomerő mikroszkópia. Immuncitokémia (fény- és elektronmikroszkópos szinten)
  8. A sejtközötti állomány szerkezetének vizsgálata
  9. Lipidek kivonása, tisztítása, elválasztása
  10. A lipoproteinek koncentrációjának klinikai-kémiai mérése
  11. A lipoproteinek analitikai és preparatív ultracentrifugálása.
  12. Izotópok használata a patobiokémiai diagnosztikában
  13. A nukleotid-anyagcsere vizsgálati módszerei
  14. Restrikciós endonukleázok alkalmazása a molekuláris biológiai gyakorlatban
  15. Restrikciós analízis, hibridizációs eljárások, blot technikák
  16. Nukleinsav- és fehérjeszekvenciák meghatározása
  17. In vitro transzláció, fehérje-overexpresszió prokarióta és eukarióta sejtekben
  18. PCR és alkalmazása, kvantitatív valós idejű PCR technikák
  19. Genomikus és cDNS könyvtár előállítása, génkönyvtár klónjainak azonosítása
  20. Egyetlen nukleotidra kiterjedő genetikai variációk: SNP-k és pontmutációk vizsgálati módszerei az orvosi és laboratóriumi gyakorlatban
  21. Az orvosi diagnosztikában alkalmazott molekuláris biológiai módszerek csoportosítása működési elvük szerint (pl. amplifikáción, hibridizáción stb. alapuló eljárások)
  22. Ismétlődési polimorfizmusok (VNTR, inszerció, deléció) gyakorlati jelentősége és vizsgálómódszerei
Felkészülésre ajánlott tankönyvek:
Lehninger-Nelson-Cox: Principles in Biochemistry
Devlin: Biochemistry